دانشجویان کارشناسی ارشد میکروبیولوژی جهرم 87

استخراج DNA با استفاده از روش فنول کلروفرم بهترین روش استخراج DNA

احمد نیکنام — 2012-02-19T03:57:12+01:00

استخراج DNA با استفاده از روش فنول کلروفرم بهترین روش استخراج DNA

مواد مورد استفاده:
فنول ، کلروفرم، EDTA)Lysis،Tris،D.W،(SDS،آمونیوم استات،اتانول 100,70%، Protenas K، Solvent
لوله فالکون حاوی فنول باید درون دمای یخچال و به صورت ایستاده قرار گرفته باشد(چون حاوی دو فاز می باشد و نباید دو فاز با هم مخلوط شوند.فاز زیرین حاوی ترکیب فنول و فاز رویی حاوی Tris جهت جلوگیری از اکسیده شدن محلول فنول می باشد).از قبل محلولی جهت لایز کردن دیواره سلولی آماده کردیم(از ترکیبی از موادTris 10mµ 0.1211gr , EDTA 0.1µ 3.722 gr , SDS 0.5% با D.Wبه حجم 100ml رساندیم.جهت اینکه این مواد خوب در محلول حل شوند مقداری ورتکس کردیم و به مدت 15minدر دمای 50 درجه سانتی گراد دستگاه فور گذاشتیم).مراحل انجام کار چه افزودن و چه برداشتن محلول در این روش زیر هود انجام می گیرد.

100µlاز Buffy coatکه قبلا آماده کردیم را درون میکروتیوپ 2ml می ریزیم، بعد 400µl از محلول lysis که قبلا آماده کردیم را به آن اضافه و 3تا 6 ثانیه ورتکس تا خوب در هم حل شوند بعد 10 ثانیه میکروفیوژ میکنیم تا محلولی که به دواره و در میکروتیوپ چسبیده به قسمت پایین میکروتیوب بیاید،در مرحله بعد به مدت یک ساعت میکرو تیوب ها را در دمای 25 درجه سانتی گراد Dry-block قرار میدهیم تا محلول حاوی لایزز بتواند دیواره سلولی را باز کرده و محتویات سلولی را در دسترس قرار دهد.بعد از زمان مورد نظر به هر میکروتیوب 2 µlاز Protenas K اضافه،3 تا 4 ثانیه ورتکس و بعد 10 ثانیه میکروفیوژ و بعد به مدت 3ساعت میکرو تیوب ها را در دمای 25 درجه سانتی گراد Dry-block قرار میدهیم تا Protenas K درون محلول بتواند DNAدرون هسته را جدا می کند.داخل یک بشر 50ml محلول ویست 10%جهت غیر فعال کردن مواد و محلول های اضافی درست میکنیم(شامل 10mlاز محلول وایتکس و90mlآب)در مرحله بعد چون مواد و ناخالصی های درون محلول(شامل دیواره های سلولی) زیاد شده هم حجم محلول درون میکروتیوب از محلول فنول اضافه و 10 ثانیه ورتکس انجام می دهیم و بعد هم حجم فنول به محلول کلرو فرم(باید در دمای یخچال نگهداری شود) اضافه می نماییم و مجددا 10 ثانیه ورتکس میکنیم و بعد 15min با دور 14000rpm در دمای 4 درجه سانتی گراد سانترفیوژ(یخچال دار) می نماییم.در این مرحله فنول باعث جدا سازی هیستون ها و پروتئین ها از DNAشده و آن را خالص و عاری از هر ناخالصی می کند،نباید زیاد فنول را درون محلول نگه داشت زیرا باعث میشود که به خود DNA هم آسیب برسد،کلروفرم هم باعث می شود که فاز آلی و آبی از هم جدا شوند، فاز آلی که در پایین میکروتیوب قرار می گیرد شامل فنول ،کلروفرم، و مواد اضافی و جدا شده از DNA(دیواره سلولی و پروتئین ها) می باشد. فاز رویی هم شامل آب و DNA می باشد،بعضی از میکروتیوب ها هم یک رینگ بین فاز آلی و فاز آبی تشکیل می دهند شامل پروتئین جدا شده از DNA می باشد که این رینگ به رنگ شیری کدر از دو فاز قابل تمایز می باشد.

باید به آرامی میکروتیوب ها را از درون دستگاه سانترفیوژ خارج کرد که فاز ها با هم مخلوط نشوند،بعد زیر هود فاز رویی را درون یک میکروتیوب دیگر میریزیم (به هیچ عنوان نباید رینگ حاوی پروتئین بین دو فاز به فاز آبی به میکروتیوب جدید منتقل شود زیرا در مرحله آخر مشاهده باند اسمیر فراوان مانع دیدن باند می گردد).فاز زیری(فاز آلی)را درون ظرف ویست که از قبل آماده کردیم میریزیم تا اگر DNA یا مواد دیگر در آن باشد غیر فعال شوند. در صورتی که محلول آبی که جدا کردیم کدر باشد یک بار دیگر مرحله قبل را تکرار(یعنی هم حجم این محلولی که داریم کلروفرم اضافه میکنیم تا ضایعاتی که درون محلول مانده جدا کند و مجددا فاز رویی را درون یک میکروتیوب دیگر می ریزیم.در این مرحله دیگر نیازی به افزودن فنول نیست،فقط کلروفرم اضافه و مراحل را انجام می دهیم).

در مرحله آخر جدا کردن فاز آبی میزان دقیق فاز آبی را با کشیدن با سمپلراندازه میگیریم،بعد به اندازه 0.2 درون هر میکروتیوب که جدا کردیم استات آمونیوم 10 µ اضافه و دو برابر حجم اتانول 100% اضافه میکنیم .در این مرحه وقتی حلال آب باشه چون قدرت یونی نسبتا بالایی داره مولکول های اسیدنوکلئیک (گروه های فسفات باردار) با آب واکنش میدن و خوب در آب حل می شوند (به همین جهت با محلول های آلی میشود اسید نوکلئیک را از بقیه ی اجزای سلولی جدا کرد). وقتی اتانول به محلول اضافه میشود قدرت یونی حلال کم و تمایل اسید نوکلئیک هم به حلال کم و با یون های موجود در محیط(در اینجا استات آمونیوم) واکنش و سنگین میشود و رسوب می کند. نباید در این مرحله با دستگاه ورتکس محلول را بهم زد زیرا رشته های DNA شکل گرفته و در صورت ورتکس آنها تیکه تیکه می شوند و برای همین باید به آرامی بین انگشتان دست به مدت 10 دقیقه میکروتیوب ها را تکان داد تا خوب محلول حل شود در این مرحله میتوان بار اول تکان دادن میکروتیوب ، با چشم غیر مسلح رشته های DNA که با ترکیب آمونیوم استات ضخیم شده اند را مشاهده نمود.بعد میکروتیوب ها را جهت آبگیری هر چه بهتر اتانول به مدت حداقل یک ساعت درون فریزر با دمای -20 قرار داد که ما در این مطالعه به مدت 16 ساعت این مرحله را انجام می دادیم در صورتی که خوب اتانول با محلول حل نشده باشد محلول دچار یخ زدگی میشود زیرا اتانول عمل آبگیری را انجام می دهد.بعد از این مرحله میکرو تیوب ها نباید دچار یخ زدگی شده باشند،در صورت یخ زدگی باید منتظر ماند تا در دمای محیط یخ آنها باز شود و بعد در دستگاه سانتر فیوژ با دور 14000rpm و زمان 15min و دمای 4درجه سانتی گراد سانترفیوژ را جهت رسوب DNAانجام می دهیم،در این مرحله مثل مراحل قبل یک ظرف حاوی محلول ویست آماده می نماییم،بعد از اتمام سانترفیوژ محلول را به صورت یکدفعه درون ظرف ویست خالی میکنیم و آن را بر میگردانیم در مرحله بعد به هر میکروتیوب حاوی رسوب DNA به اندازه مجموع حجم Buffy Coat اولیه و مححلول لیزیز که جمعا 500mlشده بود الکل 70% اضافه میکنیم و به آرامی 3تا 6 ثانیه ورتکس میکنیم تا رسوب DNAدرون الکل حل شود .سپس با دور 14000rpm، دمای 4درجه سانتی گراد،10min سانترفیوژ می کنیم.بعد از سانترفیوژ محلول را دروز ضرف ویست خالی میکنیم و روی گاز استریل میکروتیوب ها را برمیگردانیم تا قطرات الکل باقی مانده خالی شود بعد میکرو تیوب ها را در دمای 37 درجه سانتی گراد Dry-block قرار میدهیم تا قطرات الکل از میکرو تیوب بخار شوند،جهت فهمیدن اینکه الکل کامل از میکروتیوب کامل بخار شده یا نه میکروتیوب رو روبروی چشممان میگیریم و و با انگشت به آرامی به ته میکرو تیوب ضربه میزنیم که اگه قطرات ریزی مانده باشده مشخص می شود.بعد از تبخیر کامل الکل از میکرو تیوب ها به ازای 100mlاز Buffy Coat اولیه به هر میکروتیوب 20 µl از محلول Solvent کیت DNP^TMاضافه و بعد میکروتیوب ها را به آرامی 3تا 6 ثانیه جهت حل شدن DNAدرون Solvent به آرامی ورتکس می کنیم بعد 2 دقیقه میکروتیوب ها را در دمای 37 درون Dry-block جهت بهتر حل شدن DNA قرار می دهیم و سپس میروتیوب های حاوی محلول DNAرا به درون فریزر با دمای -20 درجه سانتی گراد جهت انجام PCR قرار می دهیم. حداقل باید یک ساعت نمونه جدا شده DNAدرون فریزر بماند و بعد PCR انجام شود.

گردآورنده: احمد نیکنام

جهت هر گونه سوال در مورد این روش با این ایمیل در تماس باشید

AHMADNIKNAM@HOTMAIL.COM

چند توصیه مفید برای به خاطر سپردن مطالب

اكرم نجفی — 2012-02-04T16:25:05+01:00

با سلام

دکتر هرمان ابینگهاوس در سال 1885 تحقیقی در مورد روند فراموشی نسبت به زمان انجام داد که شایان توجه بود. به گزارش برترین ها وی فهرستی شامل 13 کلمه بی معنی را به صورت کامل حفظ کرد و بعد از فواصل زمانی مختلف (از 20 دقیقه تا 31 دقیقه) خود را می آزمود تا بداند در هر فاصله زمانی چه تعداد از واژه ها را به خاطر سپرده است. نتایج وی به قرار زیر بود:
پس از 20 دقیقه 60 درصد مطالب را حفظ بود، پس از یک ساعت کمتر از 50 درصد، پس از 8 ساعت کمتر از 40 درصد، پس از 24 ساعت نزدیک 30 درصد، پس از پنج روز کمتر از 30 درصد و بالاخره پس از 31 روز نزدیک 20 درصد مطالب در حافظه او باقی مانده بود. به عبارت دیگر این آزمایش به سادگی نشان داد 40 درصد مطالب در 20 دقیقه نخست و 70 درصد طی 48 ساعت نخست اگر مرور صحیح صورت نگیرد فراموش می شوند.
زمان مرور
باتوجه به اینکه طبق یافته های ابینگهاوس بیشترین میزان فراموشی (70 درصد) در 24 تا 48 ساعت نخست اتفاق می افتد پس مهم ترین زمان های مرور همان 48 ساعت اولیه است. به گزارش برترین ها مرور بلافاصله مطالب خوانده شده، تاثیر بسزایی در تثبیت مطالب و جلوگیری از فراموشی آنها دارد. 10 تا 20 دقیقه از زمانی را که برای مطالب هر درس درنظر گرفته اید را صرف مرور مطالب خوانده شده در همان جلسه کنید، تعجب خواهید کرد از اینکه مقداری از مطالب را در همان دقایق اولیه فراموش کرده اید.
یادداشت و نت برداری
برای اینکه بتوانید همیشه و در کلیه امتحانات نمره الف بگیرید یادداشت برداری موثر و صحیح یک عامل ضروری و اساسی است.
چراکه با خلاصه برداری دفعات مرور شما بیشتر می شود و فراموشی به حداقل می رسد، قسمت اعظم درس خواندن شما باید از روی یادداشت برداری های شما باشد.
20 نکته در یادداشت برداری
1 – ابتدا حجمی را که می خواهید خلاصه برداری کنید مشخص کنید.
2 – با تورق سریع از اصل موضوع اطلاعات کسب کنید به شکل ها، تیترها و عناوین کتاب دقت کنید.
3 – یادداشت ها را براساس اشخاص، فرمول ها، اصطلاحات، تعاریف و... دسته بندی کنید.
4 – از درخت حافظه استفاده کنید که از نظر سازماندهی ذهن و تاثیر در یادگیری از کارآیی فوق العاده ای برخوردار است. برای این کار باید عنوان فصل را به عنوان ریشه درخت در داخل یک دایره، مربع یا هر شکل هندسی مطلوب در سمت راست قرار دهید و سپس نکات اصلی و فرعی را روی شاخه های اصلی و فرعی در سمت چپ بنویسید. در این تکنیک از هر دو نیم کره مغز استفاده می شود.
5 – مطالب را رونویسی نکنید به زبان خودتان بنویسید.
6 – اصل نظم و زیبایی را در خلاصه برداری رعایت کنید.
7 – مطالب باید کوتاه باشند اما مفهوم را برسانند ترجیحا فعل داشته باشند.
8 – سعی کنید یادداشت هایتان در حدی مطمئن باشد که جایگزین مناسبی برای منابع اصلی باشد.
9 – خلاقیت در یادداشت برداری را فراموش نکنید. چه به لحاظ نحوه نگارش و چه به لحاظ شکل نوشتار و نمودارهایی که به کار می برید.
10 – کدگذاری کنید: مثلا در درس فارسی برای به خاطر سپردن آثار نظامی (ملخ ها): م (مخزن الاسرار)، ل (لیلی و مجنون) خ (خسرو و شیرین)، ه (هفت پیکر) و الف (اسکندرنامه)
11 – از علامت های اختصاری استفاده کنید.
12 – میزان اهمیت مطالب را با علائم هندسین نشان دهید.
13 – مقابل هر شاخه فرعی از مثال ها استفاده کنید.
14 – نمودارها و تحلیل آن را به صورت جامع بنویسید.
15 – در صورت نیاز از شکل های آن مطلب کمک بگیرید.
16 – بالای هر خلاصه برداری آدرس کامل آن را که شامل عنوان فصل، صفحه و نام کتاب است بنویسید.
17 – یادداشت ها باید به گونه ای باشد که قابل حمل باشد. بنابراین استفاده از سررسید یا سالنامه را پیشنهاد نمی کنیم.
18 – بهترین راه خلاصه برداری آن است که آنها را روی اوراقی جداگانه و به هم پیوسته بنویسید تا اگر نیازی به چک کردن و اصلاح آن بود بتوانیم با بازنویسی آن دوباره مجموعه ای قابل قبول داشته باشیم.
19 – در پایان خلاصه برداری سعی کنید درخت حافظه خود را یک بار مرحله به مرحله مرور و به خاطر آورید.
20 – در هر فرصتی خلاصه هایتان را مرتب مرور کنید.

موفق باشید./

مدرک MSRT مورد نیاز برای ورودی دکتری

احمد نیکنام — 2011-10-15T09:03:32+01:00

آزمون MCHE، در مقایسه با امتحاناتTOEFL و IELTS ، ساده‌تر و كم هزینه‌تر است. امتحان MCHE بهعنوان مجوز ورود دانشجو به دوره دكتری داخل كشور تلقی می‌شود و اگر دانشجویی این مدرك زبان را نداشته باشد، نمی‌تواند به دوره دكتری وارد شود، ولی تنها در داخل كشور دارای اعتبار است

این آزمون از سه قسمت تشکیل شده است:

1.Listening Comprehension : شامل 30تست می باشد.

در این قسمت از مکالمات کوتاه (Short Conversation) سوال داده می شود که دو نفر یک مکالمه کوتاه انجام داده و آنگاه سوال پرسیده می شود.باید توجه نمود جهت پاسخگویی به سوالات این بخش بایستی روی صحبتهای نفر دوم بیشتر توجه نمود. زمان 15 دقیقه.

2. Structure and Written Expression: این قسمت از 30 تست تشکیل شده است که 15 مورد آن مربوط به Structure و 15 تست دیگر مربوط به Written Expression می باشد زمان 20 دقیقه.

جهت کسب نمره بالای 50 این قسمت نقش کلیدی دارد.

3.Reading Comprehension : از 40 تست تشکیل شده که معمولا شامل 4 متن جداگانه می باشد زمان 45 دقیقه.

مرتبط: نمونه آزمونهای MCHE

لینك آزمون اول ؛ لینك آزمون دوم

منابع و وبلاگهای خوب برای كسب اطلاعات در این زمینه:

وبلاگ MCHE

منابع سوالات شنیداری آزمون MCHE

سایت های مفید برای آموزش زبان انگلیسی(جهت دریافت مدرک زبان برای دکتری)

اكرم نجفی — 2011-06-15T02:54:10+01:00

سلام دوستان

دو سایت بسیار بسیار بسیار مفید برای كسانی كه از علاقه مندان به یادگیری زبان انگلیسی هستند(جهت دریافت مدرک زبان برای دکتری) ، معرفی می كنم. امیدوارم مورد استفاده همگی قرار بگیرد.

http://englishforyou.mihanblog.com و http://www.zabanamoozan.com

http://www.mche.blogsky.com/

پنجمین كنگره میكروب شناسی دكتر البرزی

اكرم نجفی — 2011-05-28T02:22:51+01:00

با سلام

مركز تحقیقات میكروب شناسی بالینی استاد البرزی دانشگاه علوم پزشکی شیراز در نظر دارد پنجمین کنگره سراسری میكروب شناسی بالینی ایران را در تاریخ 17 لغایت 19 آبان ماه سال 1390 در شیراز برگزار کند. این کنگره پذیرای مقالات اساتید ، دانشجویان و پژوهشگران گرامی در زمینه های مختـلف میـکروب شنـاسی بالیـنی به شرح زیر می باشد:

- باکتری شناسی بالینی - قارچ شناسی بالینی - ویروس شناسی بالینی - انگل شناسی بالینی - ایمنی شناسی بیماریهای عفونی - بیماریهای مشترک انسان و دام - مقاومت های دارویی - واکسیناسیون - سل و مقاومت دارویی.

آخرین مهلت دریافت خلاصه مقاله جهت شرکت در پنجمین کنگره میکروبشناسی بالینی ایران تا پایان وقت اداری 25 مرداد ماه 1390 خواهد بود. علاقمندان برای اطلاعات بیشتر می توانند از وب سایت كنگره به آدرس http://alborzicmrc1390.ir دیدن فرمایند.

معرفی سایت مفید علمی

اكرم نجفی — 2011-04-23T10:14:42+01:00

با سلام به شما دوستان و عزیزان و با تبریك سال جدید، قصد دارم امروز سایتی رو معرفی كنم كه شما را با دنیایی از اطلاعات و دست آوردهای جدید علمی نسبت به رشته ای كه در آن تحصیل می كنید آشنا می كند. آدرس این سایت www.researchgate.net است. شما با عضویت در این سایت علمی می توانید با محققان بسیار زیادی از سراسر جهان و از جمله ایران كه در زمینه كاری شما به مطالعه می پردازند آشنا شوید. با آنها ارتباط برقرار كنید و اگر در زمینه كارهای علمی و تحقیقاتی خود سئوال یا مشكلی دارید با آنها مطرح كنید. توصیه می كنم این سایت را به دوستان خود نیز معرفی كنید. موفق باشید.

هشدار جدی, مرگ چند نفر از هموطنانمان با تزریق پنی سیلین

احمد نیکنام — 2011-02-09T04:24:24+01:00

جهت اطلاع

تا اطلاع ثانوی به هیچ عنوان پنی سیلین نزنید

به همه اطلاع رسانی کنید

* هشدار*

*طی 2 روز 5 نفر به علت تزریق آمپول پنی سیلین و راینتیدین در یاسوج جان خود را
به دلیل نامعلومی از دست دادند و تلویزیون دولتی هم هیچ خبری را ازین داستان
تلخ منتشر نکرد. در صورت عارضه به هر گونه بیماری میکروبی یا هرنوع بیماری که
لازم به استفاده از آنتی بیوتیک است و یا تزریق وریدی می باشد ، از تزریق ممانعت
به عمل آورید .و این موضوع را از طریق اینترنت و سایت های مستقل پیگیری کنید تا
علت آن مشخص شود.

http://www.aftabnews.ir/vdchx6nzm23nzid.tft2.html

آفتاب: یکی از جان‌باختگان، جوانی 18ساله به‌ نام "مجید شاکری"، دارای مدرک
دیپلم بوده که به علت سرماخوردگی به پزشک مراجعه کرده و گفته می‌شود بعد از
تزریق پنی‌سیلین جان خود را از دست داده است.

جوان دیگر "سیدرضا حسینی"، دارای مدرک کارشناسی‌ارشد صنایع و از مدرسان
دانشگاه‌های استان بود که پدر وی نیز از پزشکان متخصص استان است که گفته می‌شود
چند ساعت بعد از تزریق پنی‌سیلین، جان خود را از دست داد و فرد سوم نیز که
تاکنون هویت آن برای ایسنا مشخص نشده، بعد از سرماخوردگی، پنی‌سیلین تزریق کرده
و جان خود را از دست داده است.

البته این پنی سیلین ها از كشور چین وارد شده اند و دولت دارد آنها را از بازار جمع میكند اما هنوز تو بازار هستند

لینک های مرتبط دیگر

http://www.fardanews.com/fa/news/131723

http://ebratnews.com/?part=news&inc=news&id=28746

معرفی انواع محیط های کشت باکتریایی (دارو درمان - ازمایشگاه - میکروبیولوژی) قسمت دوم

احمد نیکنام — 2011-01-29T13:45:59+01:00

معرفی محیط های کشت باکتریایی

قسمت دوم

دارو درمان - ازمایشگاه - میکروبیولوژی

در ادامه مطلب مطالعه فرمایید

معرفی انواع محیط های کشت باکتریایی (دارو درمان - ازمایشگاه - میکروبیولوژی) قسمت اول

احمد نیکنام — 2011-01-29T13:43:36+01:00

معرفی محیط های کشت باکتریایی

قسمت اول

دارو درمان - ازمایشگاه - میکروبیولوژی

در ادامه مطلب مطالعه فرمایید

فعال سازی اکانت سایت کتابخانه دیجیتال(رزنت)در دانشگاه آزاد واحد جهرم

احمد نیکنام — 2010-12-27T06:19:38+01:00

با سلام

دوستان عزیز با فعال سازی اکانت سایت کتابخانه دیجیتال شما میتواند با ثبت نام در این سایت در آن مرکز دانشگاهی اکانت خود را فعال نموده (در صورتی که قبلا از دانشگاه جهرم در این سایت عضو شده اید دیگر نیازی به ساخت اکانت جدید ندارید و فقط باید آن را فعال کنید)تا بتوانید در هر جایی با اکانت خود دسترسی به مجلات و انتشارات معتبر آن جهت دریافت مقالات داشته باشید.با ؟آرزوی موفقیت برای شما دوستان عزیز

این هم لینک آدرس سایت رز نت

ثبت نام آزمون دكتری تخصصی دانشگاه آزاد

اكرم نجفی — 2010-12-23T13:48:05+01:00

قابل توجه دوستان خوبم

ثبت نام داوطلبان آزمون دکتری تخصصی دانشگاه آزاد از ساعت 8 صبح 9 دی از طریق پایگاه اینترنتی به نشانی http://www.azmoon.org انجام می شود.
مهلت ثبت نام این آزمون تا ساعت 24 شنبه 19 دی ماه جاری ادامه دارد و داوطلبان در این مدت می توانند با مراجعه به مراکز پستی در سراسر کشور و تهیه دفترچه راهنما و کارت اعتباری به ثبت نام از طریق پایگاه اینترنتی اقدام کنند. همچنین متقاضیان دوره بدون آزمون دکتری تخصصی نیز می توانند با مراجعه به مراکز پستی و تهیه کارت اعتباری 90 هزار ریالی به ثبت نام در این دوره اقدام کنند.

موفق باشید

اولین كنگره بین المللی و دوازدهمین كنگره ملی میكروبیولوژی

اكرم نجفی — 2010-11-28T16:19:50+01:00

با سلام

اولین كنگره بین المللی و دوازدهمین كنگره میكروب شناسی ایران سوم تا ششم خرداد ماه 1390 یا به عبارتی 23 تا 26 ماه May سال 2011 در دانشگاه علوم پزشكی كرمانشاه برگزار می شود.

مهلت ارسال چكیده مقالات از 10 آذر تا 12 بهمن(1 December, 2010 تا1 February, 2011 ) بوده و مهلت ثبت نام در كنگره نیز از 10 آذر تا 25 اسفند (1 December, 2010 until 16 March, 2011) می باشد.

محورهای كنگره شامل موارد زیر می باشد:

- Basic Microbiology

- Challenges in Microbiology (Education, Research, Future)

- Diagnostic Microbiology

- Drug Resistance

- Environmental Microbiology

-Immunology and Pathogenesis of Microorganisms

- Microbial Biotechnology

- New Trends in Microbiology

- Nosocomial Infections

- Pharmaceutical and Food Microbiology

- Re or New Emerging Infectious Diseases

متن چكیده باید كمتر از 250 كلمه باشد و فرمت آن به صورت زیر باشد:

Background - Objectives - Methods – Discussion- Conclusions

علاقمندان برای اطلاعات بیشتر می توانند از وب سایت كنگره به آدرس

www.kicm2011.ir دیدن فرمایند.

تشخیص سریع مولکولی لیستریامنوسیتوژنز به روش PCR با استفاده از ژن hlyA

احمد نیکنام — 2010-11-28T10:48:52+01:00

نجفی علی,قربان علی زادگان مهدی,توكلی حمید*,احمدی علی

* گروه تغذیه مرکز تحقیقات بهداشتی، دانشگاه علوم پزشکی بقیه اله (عج)

زمینه و اهداف: در حال حاضر روش استاندارد برای تشخیص لیستریا مونوسیتوژنز كشت می باشد. به علت این که در خوراک دام از آنتی بیوتیك استفاده می شود و این باکتری داخل سلولی می باشد حساسیت كشت به شدت كاهش می یابد. به علاوه، تشخیص با این روش بیشتر از 36 ساعت طول می کشد. لذا، دست یابی به آزمونی كه بتواند در هر شرایطی وجود لیستریا مونوسیتوژنز را در نمونه بالینی نشان دهد، ارزشمند می باشد. هدف این مطالعه تشخیص سریع مولکولی لیستریا مونوسیتوژنز به روش PCR با استفاده از ژن hlyA بود.
روش بررسی: ژن hlyA به عنوان ژن اختصاصی برای شناسایی لیستریا مونوسیتوژنز انتخاب گردید. به منظور بهینه سازی آزمایش از سویه استاندارد لیستریا مونوسیتوژنز PTCC: 1163 استفاده شد. برای بررسی اختصاصیت از باکتری های سالمونلا تیفی PTCC: 1609، لیستریا مونوسیتوژنز PTCC: 1163 و اشریشیاکلی ATCC: 35218، استفاده شد. برای استخراج DNA از روش فنل - کلروفرم استفاده شد و محصول 210bp پس از الکتروفورز در ژل آگارز %1 در دمای اتاق با رنگ اتیدیوم بروماید رنگ آمیزی و مورد شناسایی قرار گرفت.
یافته ها: نتایج این مطالعه نشان داد که سویه استاندارد محصول مورد نظر را تولید می نماید. در حقیقت، جفت پرایمر انتخاب شده محصولی در اندازه 210bp تولید می کند. آزمایش اختصاصیت نشان داد که روش حاضر با هیچ یک از باکتری های غیرهدف واکنش نشان نمی دهد. بررسی حساسیت نشان داد که حد نهایی تشخیص DNA لیستریا مونوسیتوژنز در این روش 500fg می باشد.
نتیجه گیری: نتایج بهینه سازی نشان داد که روش PCR به كار رفته در این مطالعه از سرعت، حساسیت و اختصاصیت لازم برخوردار است و نتیجه نهایی در کمتر از سه ساعت بدست می آید. به کارگیری این روش در آزمایشگاه ها تشخیص لیستریا مونوسیتوژنز را امکان پذیر می نماید.

كلید واژه: لیستریامونوسیتوژنز،PCR ، ژن hlyA

دانلود

معرفی ژورنال های ISI میكروبیولوژی و IF آنها

اكرم نجفی — 2010-11-14T16:29:42+01:00

با سلام

كوروش كبیر می گوید : زادگاه و تاریخ تولد هیچكس در هیچ نقشه و تقویمی نیست. چرا كه آدمها هر لحظه در طپش قلب كسانی كه دوستشان دارند متولد می شوند.

در این پست به معرفی چند ژورنال ISI كه در زمینه میكروبیولوژی فعالیت می كنند و نیز impact factor های آنها می پردازم. سعی می كنم به زودی نحوه نوشتن یك مقاله ISI را نیز توضیح دهم.

AFR J MICROBIOL RES 0.4

ANN MICROBIOL 0.5

ANNU REV MICROBIOL 10.9

ARCH MICROBIOL 2.0

BMC MICROBIOL 2.9

BRAZ J MICROBIOL 0.5

CAN J MICROBIOL 1.1

CLIN MICROBIOL INFEC 3.6

CLIN MICROBIOL REV 16.4

CRIT REV MICROBIOL 2.8

CURR MICROBIOL 1.3

EUR J CLIN MICROBIOL 2.9

FOLIA MICROBIOL 1.2

FUTURE MICROBIOL 2.0

INT J MED MICROBIOL 3.5

INT MICROBIOL 2.2

J APPL MICROBIOL 2.0

J CLIN MICROBIOL 3.9

J MED MICROBIOL 2.2

J MICROBIOL 1.4

LETT APPL MICROBIOL 1.7

MICRO 0.6

MICROBES INFECT 2.8

MICROBIOLOGY+ 0.7

NEW MICROBIOL 0.9

RES MICROBIOL 2.1

REV MED MICROBIOL 0.8

VET MICROBIOL 2.4

نحوه نوشتن مقاله علمی- پژوهشی

اكرم نجفی — 2010-11-05T11:40:01+01:00

با سلام

در ابتدا درود و سپاس بی نهایت خود را به حضور تمامی دوستان عزیزی كه در جلسه دفاع من شركت كردند و یا با ایمیل و تماس اظهار لطف كردند تقدیم می دارم امیدوارم به زودی شاهد موفقیت های این عزیزان نیز باشم.

به طبع لذت بخش ترین قسمت یك كار پژوهشی پس از به اتمام رسیدن آن !! ارائه آن كار در قالب یك مقاله علمی - پژوهشی و آشنایی سایر محققان با نتایج كار خود می باشد. به همین دلیل سعی می كنم در ادامه به نحوه نوشتن كلی یك مقاله علمی – پژوهشی اشاره ای داشته باشم. اما قبل از آن لازم به ذكر است كه شما با توجه به موضوعی كه كار كرده اید می توانید از سایت WWW.SID.IR در قسمت نشریات علمی پژوهشی ، مجله مورد نظر خود را پیدا كنید. از آنجایی كه تقریباً هر مجله فرمت خاصی را برای نوشتن مقاله دارد بنابراین باید وارد سایت آن مجله شوید و در قسمت راهنمای نویسندگان از نحوه نوشتن مقاله آگاهی پیدا كنید.

نكته: تعداد صفحات هر مقاله از حداكثر 12 صفحه (شامل متن، جداول، نمودارها، تصاویر) نباید تجاوز كند.

1- عنوان مقاله: تقریباً مهمترین بخش كار است. چون این عنوان در عین كوتاهی باید گویای پژوهش شما نیز باشد. همچنین در این قسمت به جای استفاده از كلمات لاتین باید آوا نویسی آنها را به كار برد.

2- چكیده فارسی: باید بین 150 تا 250 كلمه و شامل موارد زیر باشد:

زمینه: شامـل توضیح سوال اصلی و هـدف از نگارش یا ارائه فرضیه است.

مواد و روش‌ها: شامل روش پژوهش، خصوصاً نوع روش‌های آماری و ذكـر مشخصات كامل نمـونه‌های شركـت كننده از جمله جمعیت مورد مطالعه، حجم نمونه و غیره است.

یافته‌ها: شامل خلاصه اطلاعات و داده‌های به دست آمـده و مهمترین یافته‌های پژوهش است.

نتیجه‌گیـری: شامل خلاصه‌ای از تفسیـر و شرح یافته‌ها ذكر نتیجه نهایی تحقیق می‌باشد.

واژگان كلیدی: معمولاً بین 4 تا 8 كلمه است.

3- چكیده انگلیسی: باید دقیقاً مطابق با چكیده فارسی تهیه شود و بین 150 تا 250 كلمه باشد.

4- مقدمه: این قسمت هـدف مقالـه را بیـان می‌كند و دلیل منطقـی انجـام پـژوهش و نگارش مقاله را بیان می كند.

حجـم مقـدمه باید به گونه ای باشد كه حداكثر در یك صفحه A4 ارائه گـردد. در متن منابع مورد استفاده به ترتیب استناد، شماره‌گذاری می گردند.

5- مواد و روش‌ها: این قسمت قلب یك مقاله است و باید با یك توالی منطقی شرح دهد كه مطالعه چگونه برنامه ریزی و اجرا شده و داده ها چگونه تحلیل شده اند (ذكر نسخه SPSS یا نرم افزار و روش های آماری مورد استفاده). تجهیزات مورد استفاده به طور كامل توضیح داده شود (آدرس كارخانه سازنده، غیـره ...)؛ به طوری كه دیگـران قـادر باشند مـورد مشابهی را انجام دهند.

6- یافته ها: این قسمـت باید شامل مجموعه ای از متن، جدول، نمودار، تصویر و بیانی واضح و دقیق از اطلاعات به دست آمده باشد. معمولاً تعـداد تصاویر، نمـودارها و جـداول یك مقاله محدود و نبـاید بیش از یك عدد به ازاء هر 500 تا 700 كلمه (معادل سه تا چهـار صفحه A4) باشند.

7- بحث: تقریباً دشوارترین قسمت مقاله بوده و نیاز به تفكر دقیق دارد. در این قسمت باید نتایج پژوهش با یافته های به دست آمده از سایر مطالعات مقایسه شود. همچنین تعبیر و تفسیر خود را از قسمت یافته‌ها توضیح دهد. فرضیه‌های جدید را بیان كند و پیشنهاد داشته باشد.

8- نتیجه گیری: شامل نتیجه‌گیری نهایی بوده و معمولاً در انتهای بحث بدون ساختار جداگانه آورده می شود.

9- سپاسگزاری: در این قسمت می توان از كلیه كسانی كه به صورت مادی و معنوی پژوهشگر را یاری كرده‌اند، تشكر و قدردانی كرد.

10- فهرست منابع: معمولاً نحوه ارائه فهرست منابع در متن بر اساس روش ونکوور و به ترتیب ورود به متن می باشد.

شیوه رفرنس نویسی قبلاً در همین سایت آورده شده است.

با آرزوی موفقیت برای همگی